2009年10月30日国家中医药管理局发文（国中医药发〔2009〕30号）公布了国家中医药重点学科，医学部有2个学科被认定：

• 中药分析学 （药学院天然药物学系）

• 中西医结合临床 （肿瘤医院中西医结合科、第一医院中西医结合科、第三医院中医科、人民医院中医科 ）

2023年5月4日国家中医药管理局发文（国中医药人教函〔2023〕85号）公布了国家中医药重点学科，医学部有3个学科被认定：

• 中药化学生物学

• 中西医结合基础（微循环）

• 中西医结合临床