北京大学基础医学学科作为新时代“北大医学”的基础学科和桥梁学科，面向新一轮科技革命前沿和人类疾病防控需求，发挥学科体系完善、综合实力突出的优势与特色，以重要系统性疾病研究为导向，促进基础研究与临床学科交叉融合，整合建设了肿瘤与干细胞、心血管与代谢、感染与免疫、神经科学等四个学科群, 形成了肿瘤、心血管与代谢性疾病、感染与免疫、干细胞等国际领先的研究方向，现有基金委创新群体3 个，2019 年董尔丹教授入选中国工程院院士。目前专任教师256 人、博士生导师99 人，院士6 人，国家各类人才计划入选者50 余人次。

  学科拥有国家重点实验室等国家级平台5 个，省部级平台10 个，2019 年詹启敏院士牵头获批基础医学首个国家基础科学中心。近5 年获批科研项目720 项，经费7.2 亿元（国家级项目经费6.04 亿）。发表论文1922 篇，在干细胞研究、心血管与代谢性疾病发病机制、表观遗传与肿瘤发生及治疗等领域取得突破性进展，在Science、Cell、NEJM 等期刊发表系列代表作。获批I类新药进入III 期临床试验2 项。获得国家自然科学奖1 项、国家科技进步奖1 项。干细胞治疗核心技术研发、重大传染病防治、医学生物信息共享等科技服务和医学服务成效显著。细胞生物学系主任邓宏魁教授在NEJM 发表基因编辑技术治疗艾滋病研究成果，入选《Nature》2019 年度“十大科学人物”。在肿瘤等疾病的诊疗与防控等方面，签约技术开发、转让合同金额1.1 亿元。

  学科生物化学、神经科学等5 个二级学科进入ESI 学科全球前1%，“解剖学与生理学”在2020 QS 世界大学学科排名位居31 位。获教育部第三轮学科评估排名第一、第四轮学科评估 “A+”，入选国家“双一流”建设学科，2018-2020 年连续三年获“软科中国最好学科排名”第一。